Главная Карта сайта Контакты Печать

Публикации

Публикации

2017 год

  1. Sokolova Olga S., Chemeris Angelina, Guo Siyang, Alioto Salvatore L., Gandhi Meghal, Padrick Shae, Pechnikova Evgeniya, David Violaine, Gautreau Alexis, Goode Bruce L. Structural basis of Arp2/3 complex inhibition by GMF, Coronin, and Arpin. Journal of Molecular Biology, 2017, v. 429(2), p. 237-248. Full-text PDF

2016 год

  1. Lyupina Yulia V., Zatsepina Olga G., Serebryakova Marina V., Erokhov Pavel A., Abaturova Svetlana B., Orlova Olga V., Kravchuk Oksana I., Beljelarskaya Svetlana N., Lavrov Andrey I., Sokolova Olga S., Mikhailov Victor S. Proteomics of the 26S proteasome in Spodoptera frugiperda cells infected with the nucleopolyhedrovirus, AcMNPV. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, 2016, v. 1864(6), p. 738-746. Full-text PDF
  2. Maslakova A.A., Sokolova O.S., Orlovsky I.V. Alpha1-antitrypsin-derived C-terminal peptide activity at subnanomolar to micromolar concentrations in human cell lines: a mitogen and a metabolism activator. Molecular Biology of the Cell, 2016 ASCB Annual Meeting Abstracts, v. 27(25), p. 3947-P1169. Full-text PDF
  3. Polevova Svetlana, Kramina Tatiana, Sokolova Olga S. A novel approach to evaluate ultrathin section distortion. Microscopy and analysis, 2016, v. 30(5), p. S8-S10. Full-text PDF
  4. Semenyuk PI, Orlov VN, Sokolova OS, Kurochkina LP. New GroEL-like chaperonin of bacteriophage OBP P. fluorescens suppresses thermal protein aggregation in an ATP-dependent manner. Biochemical Journal, 2016, v. 473(15), p. 2383-2393. Full-text PDF
  5. Stanishneva-Konovalova Tatiana B., Kelley Charlotte F., Eskin T.L., Messelaar Emily M., Wasserman S.A., Sokolova Olga S., Rodal Avital A. Coordinated autoinhibition of F-BAR domain membrane binding and WASp activation by Nervous Wreck. Proc Natl Acad Sci USA, 2016, v. 113(38), p. E5552-61. Full-text PDF
  6. Волох О.И., Деркачева Н.И., Студитский В.М., Соколова О.С. Структурные исследования факторов ремоделирования хроматина. Молекулярная биология, 2016, том 50, № 6, с. 1-13. Full-text PDF English Full-text PDF Russian
  7. Волох О.И., Шей Ф.К., Карлова М.Г., Трифонова Е.С., Студитский В.М., Соколова О.С. Исследование прохождения РНК-полимеразы через нуклеосому методом электронной криомикроскопии. Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, 2016, № 1, с. 41-45. Full-text PDF
  8. Глухов Г.С., Попинако А.В., Гризель А.В., Шайтан К.В., Соколова О.С. Cтpоение человечеcкого калиевого потенциал-завиcимого канала Kv10.2 с удаленным цитоплазматичеcким доменом Pas. Biophysics, 2016, v. 61(4), p. 591-595. Full-text PDF English Full-text PDFRussian
  9. Станишнева-Коновалова Т.Б., Деркачева Н.И., Полевова С.В., Соколова О.С. Роль белков семейства BAR в регуляции динамики клеточных мембран. Acta Naturae, 2016, том 8, № 4, с. 121-131. Full-text PDF

2015 год

  1. Antonenko Yuri N., Gluhov Grigory S., Firsov Alexander M., Pogozheva Irina D., Kovalchuk Sergey I., Pechnikova Evgeniya V., Kotova Elena A., Sokolova Olga S. Gramicidin A disassembles large conductive clusters of its lysine-substituted derivatives in lipid membranes. Physical Chemistry Chemical Physics, 2015, v. 17, p. 17461-17470. Full-text PDF
  2. Clare Daniel Kofi, Pechnikova Eugenia V., Skurat Eugene V., Makarov Valentin V., Sokolova Olga S., Solovyev Andrey G., and Orlova Elena V. Novel Inter-Subunit Contacts in Barley Stripe Mosaic Virus Revealed by Cryo-Electron Microscopy. Structure, 2015, v. 23, p. 1-12. Full-text PDF
  3. Efremov YM, Dokrunova AA, Efremenko AV, Kirpichnikov MP, Shaitan KV, Sokolova OS. Distinct impact of targeted actin cytoskeleton reorganization on mechanical properties of normal and malignant cells. Biochimica et Biophysica Acta - Molecular Cell Research, 2015, v. 1853(11), p. 3117-3125. Full-text PDF
  4. Gaykalova Daria A., Kulaeva Olga I., Olesya Volokh, Shaytan Alexey K., Fu-Kai Hsieh, Kirpichnikov Mikhail P., Sokolova Olga S., Studitsky Vasily M. Structural analysis of nucleosomal barrier to transcription. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015, v. 1129(43), p. E5787-E5795. Full-text PDF
  5. Kelley C.F., Messelaar E.M., Eskin T.L., Wang S., Song K., Vishnia K., Becalska A.N., Shupliakov O., Hagan M.F., Danino D., Sokolova O.S., Nicastro D., Rodal A. Membrane charge directs the outcome of F-BAR domain lipid binding and autoregulation. Cell reports, 2015, v. 13, p. 1-13. Full-text PDF
  6. Petrova T., Slutskaya E., Boyko K., Sokolova O., Rakitina T., Korzhenevskiy D., Gorbacheva M., Bezsudnova E., Popov V. The localization of Trp residues on the surface of the dodecamer of the aminopeptidase APDkam598 from the archaeon Desulfurococcus kamchatkensis. Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications, 2015, v. 71(3), p. 277-285. Full-text PDF
  7. Stanishneva-Konovalova T.B., Sokolova O.S. Molecular dynamics simulations of negatively charged DPPC/DPPI lipid bilayers at two levels of resolution. Computational and Theoretical Chemistry, 2015, v. 1058, p. 61-66. Full-text PDF
  8. Казакова Т.А., Карлова М., Соколова О.С., Максимов Г.В. Исследование калиевых каналов в нервной клетке с помощью комплекса "квантовая точка-блокатор". Российские нанотехнологии, 2015, том 10, № 3-4, с. 110-114. Full-text PDF
  9. Маслакова А.А., Телков М.В., Орловский И.В., Соколова О.С. Сравнительный анализ экспрессии гена Serpina1 в клеточных линиях опухолевого происхождения. Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, 2015, № 3, с. 26-31. Full-text PDF English Full-text PDFRussian
  10. Оршанский И.А., Попинако А.В., Коромыслова А.Д., Волох О.И., Шайтан К.В., Соколова О.С. Молекулярная динамика взаимодействий N- и С-концевых доменов при автоингибировании и активации формина mDia1. Биофизика, 2015, том 60, № 3, с. 451-456. Full-text PDF
  11. Печникова Е.В., Кирпичников М.П., Соколова О.С. Радиационные повреждения в криоэлектронной микроскопии: всегда ли во вред? Природа, 2015, № 3, с. 25-29. Full-text PDF

2014 год

  1. Grizel A., Popinako A., Kasimova M.A., Stevens L., Karlova M., Moisenovich M.M., Sokolova O.S. Domain Structure and Conformational Changes in rat KV2.1 ion Channel. Journal of Neuroimmune Pharmacology, 2014, v. 9(5), p. 727-39. Full-text PDF
  2. Jansen S., Collins A., Golden L., Sokolova O., Goode B.L. Structure and mechanism of mouse cyclase-associated protein (CAP1) in regulating actin dynamics. Journal of Biological Chemistry, 2014, v. 289(44), p. 30732-42. Full-text PDF
  3. Sokolova O.S., Shaburova O.V., Pechnikova E.V., Shaytan A.K., Krylov S.V., Kiselev N.A., Krylov V.N. Genome packaging in EL and Lin68, two giant phiKZ-like bacteriophages of P. aeruginosa. Virology, 2014, v. 470, p. 472-478. Full-text PDF
  4. Гризель А.В., Глухов Г.С., Соколова О.С. Механизмы активации потенциал-управляемых калиевых каналов. Acta Naturae, 2014, том 6, № 4, с. 56-72 Full-text PDF English Full-text PDFRussian
  5. Загидуллин В.Э., Лукашев Е.П., Нокс П.П., Сейфуллина Н.Х., Соколова О.С., Печникова Е.В., Локштайн Х., Пащенко В.З. Свойства гибридных комплексов фотосинтетических реакционных центров бактерий Rhodobacter sphaeroides и квантовых точек в составе лецитиновых липосом. Биохимия, 2014, том 79, № 11, с. 1452-1463Full-text PDF

2013 год

  1. Becalska A.N., Kelley C.F., Berciu C., Stanishneva-Konovalova T.B., Fu X., Wang S., Sokolova O.S., Nicastro D., Rodal A.A. Formation of membrane ridges and scallops by the F-BAR protein Nervous Wreck. Molecular Biology of the Cell, 2013, v. 24(15), p. 2406-2418. Full-text PDF
  2. Chaudhry F., Breitsprecher D., Little K., Sharov G., Sokolova O., Goode B.L. Srv2/cyclase-associated protein forms hexameric shurikens that directly catalyze actin filament severing by cofilin. Molecular Biology of the Cell, 2013, v. 24(1), p. 31-41. Full-text PDF
  3. Efremov Yu M., Dokrunova A.A., Bagrov D.V., Kudryashova K.S., Sokolova O.S., Shaitan K.V. The effects of confluency on cell mechanical properties. Journal of Biomechanics, 2013, v. 46, p. 1081-1087. Full-text PDF
  4. Paley E.L., Perry G., Sokolova O. Tryptamine Induces Axonopathy and Mitochondriopathy Mimicking Neurodegenerative Diseases via Tryptophanyl-tRNA Deficiency. Current Alzheimer Research, 2014, v. 10(9), p. 987-1004.
  5. Shaitan K.V., Sokolova O.S., Kasimova M.A., Novoseletskii V.N., Kirpichnikov M.P. Influence of Interionic Interactions on Functional State and Blocker Binding of Voltage-Gated Potassium Channels. Moscow University Biological Sciences Bulletin, 2013, v. 68(1), p. 8-14. Full-text PDF
  6. Ydenberg C.A., Padrick S.B., Sweeney M.O., Gandhi M., Sokolova O., Goode B.L. GMF Severs Actin-Arp2/3 Complex Branch Junctions by a Cofilin-like Mechanism. Current Biology, 2013, v. 23(12), p. 1037-1045. Full-text PDF
  7. Печникова Е., Станишнева-Коновалова Т., Волох О., Соколова О. Повышение контраста изображения при исследовании бионаночастиц. Наноиндустрия, 2013, том 5, № 43, с. 18-25. Full-text PDF

2012 год

  1. Maiti S., Michelot A., Gould C., Blanchoin L., Sokolova O., Goode B.L. Structure and activity of full-length formin mDia1. Cytoskeleton, 2012, v. 69(6), p. 393–405. [abs]Full-text PDF
  2. Moisenovich M.M., Pustovalova O., Shackelford J., Vasiljeva T.V., Druzhinina T.V., Kamenchuk Y.A., Guzeev V.V., Sokolova O.S., Bogush V.G., Debabov V.G., Kirpichnikov M.P., Agapov I.I. Tissue regeneration in vivowithin recombinant spidroin1 scaffolds. J. Biomaterials, 2012, v. 33, p. 3887-3898. Full-text PDF
  3. Sokolova O.S., Shaitan K.V., Grizel A.V., Popinako A.V., Karlova M.G., Kirpichnikov M.P. Three-Dimensional Structure of Human Voltage-Gated Ion Channel Kv10.2 Studied by Electron Microscopy of Macromolecules and Molecular Modeling. Russian Journal of Bioorganic Chemistry, 2012, v. 38(2), p. 152–158. Full-text PDFEnglish Full-text PDFRussian
  4. Sokolova O., Ulasova N., Efremov Y., Dokrunova A., Vorontsova O., Bagrov D. Inactivation of Formin Affects Elastic Properties of Eucaryotic Cells. Microscopy and Microanalysis, 2012, том 18, № S2, с. 164-165.
  5. Sokolova O., Volokh O., Hsieh F., Studitsky V., Pechnikova E. 3D Structure of Intermediate Complexes Formed During Transcription Through Nucleosome by RNA Polymerase. Microscopy and Microanalysis, 2012, v. 18(S2), p. 120-121.
  6. Докрунова А.А., Соколова О.С. Cодержание a1-антитрипсина в сыворотке при заболеваниях предстательной железы. Урология, 2012, том 5, с. 77-80.
  7. А.В.Попинако, О.С.Соколова. Как предсказать неизвестную структуру белка. Природа, 2012, том 4, с. 33-38. Full-text PDF
  8. Соколова О.С. Наночастицы диоксида титана в различных кристаллических формах в составе солнцезащитных кремов. Токсикологический вестник, 2012, № 3, с. 38-42.
  9. Соколова О.С., Волох О.И., Станишнева-Коновалова Т.Б., Печникова Е.В. Просвечивающая электронная микроскопия для изучения структуры макромолекул. Интеграл. Научно-практический межотраслевой журнал, 2012, том 5, с. 22-25.
  10. К.В.Шайтан, О.С.Соколова, А.К.Шайтан, М.А.Касимова, В.Н.Новоселецкий, М.П.Кирпичников. Эффекты межионных взаимодействий при функционировании потенциал-зависимых калиевых каналов и связывании ими блокаторов. Вестник МГУ, Секция Биология. 2012. № 4, с. 17-23. Full-text PDF

2011 год

  1. Agapov I.I., Moisenovich M.M., Druzhinina T.V., Kamenchuk Y.A., Trofimov K.V., Vasilyeva T.V., Konkov A.S., Arhipova A.Y., Sokolova O.S., Guzeev V.V., Kirpichnikov M.P. Biocomposite scaffolds containing regenerated silkfibroin and nanohydroxyapatite for bone tissue regeneration. Dokl Biochem Biophys., 2011, v. 440, p. 228-230. Full-text PDF
  2. Danilevich V.N., Vasilenko E.A., Pechnikova E.V., Sokolova O.S., and Grishin E.V. Micro- and Nanoparticles of Condensed DNA Formed in PCR with Taq Polymerase and Plasmid DNA as a Template. Microbiology, 2011, v. 80(3), p. 420-431. [abs]Full-text PDF
  3. Levtsova O.V., Antonov M.Y., Naumenkova T.V., Sokolova O.S. Interaction of zervamicin IIB with lipid bilayers. Molecular dynamics study. Comput Biol Chem., 2011, v. 35(1), p. 34-39. [abs]Full-text PDF
  4. Moisenovich M.M., Pustovalova O.L., Arhipova A.Yu., Vasiljeva T.V., Sokolova O.S., Bogush V.G., Debabov V.G., Sevastianov V.I., Kirpichnikov M.P., Agapov I.I. In vitro and in vivo biocompatibility studies of a recombinant analogue of spidroin 1 scaffolds. J Biomed Mater Res A., 2011, v. 96(1), p. 125-131. Full-text PDF
  5. М.Г.Карлова, А.В.Пищальникова, А.А.Рамонова, М.М.Мойсенович, О.С.Соколова, К.В.Шайтан. Тест-система для изучения фолдинга калиевых потенциал-зависимых каналов, экспрессируемых in vitro. Биофизика, 2011, т. 56, вып.2, с. 243. Full-text PDF
  6. О.В.Левцова, И.Д.Давлетов, О.С.Соколова, К.В.Шайтан. Молекулярная динамика взаимодействий домена I-BAR белка IRSp53 с отрицательно заряженными мембранами. Биофизика, 2011, т.56, вып.2, с. 242-247. Full-text PDF
  7. Е.А.Плетенева, М.В.Буркальцева, О.В.Шабурова, С.В.Крылов, Е.В.Печникова, О.С.Соколова, В.Н.Крылов. Новый бактериофаг TL Pseudomonas aeruginosa и его использование для поиска фагов, образующих ореолы. Генетика, 2011, т. 47, вып.1, с. 5-9. [abs]Full-text PDF
  8. О.С.Соколова, Г.Г.Шаров, Н.Ю.Уласова, Е.В.Печникова, И.Д.Давлетов, А.А.Докрунова. Архитектура актинсвязывающих белков и их полиморфизм при онкозаболеваниях. Сборник "Постгеномные методы исследования", 2011, с. 464-491
  9. Н.Ю.Уласова, П.Г.Рубачев, Ж.К.Албегова, П.З.Хасигов, О.С.Соколова. Выделение актинсвязывающих белков из гомогентатов тканей простаты человека. Молекулярная медицина, 2011, т. 5, с. 46-50.

2010 год

  1. Sokolova O.S., Bogush V.G., Davydova L.I., Polevova S.V., Antonov S.A., Neretina T.V., Klinov D.V., Debabov V.G., Kirpichnikov M.P. The formation of a quaternary structure by recombinant analogs of spider silk proteins. Mol Biology, 2010, v. 44(1), p. 150-157. [abs]Full-text PDF
  2. Sokolova O., Filchikov M., Pechnikova E., Miroshnikov K. Structure and Virulence of Pseudomonas Aeruginosa Bacteriophages. Microsc. Microanal., 2010, v. 16 (Suppl 2). Full-text PDF
  3. И.И.Агапов, М.М.Мойсенович, Т.В.Васильева, О.Л.Пустовалова, А.С.Коньков, А.Ю.Архипова, О.С.Соколова, В.Г.Богуш, В.И.Севастьянов, В.Г.Дебабов, М.П.Кирпичников. Биодеградируемые матриксы из регенерированного шелка Bombix mori. Доклады академии наук, 2010, т. 433, № 5, с. 1-4. [abs]Full-text PDF
  4. А.А.Докрунова, Н.Ю.Уласова, Т.Е.Крамина, И.А.Альбицкий, П.З.Хасигов, О.С.Соколова. Полиморфизм альфа1-антитрипсина при раке и гиперплазии предстательной железы. Молекулярная медицина, 2010, т.6, с. 43-49. [abs]
  5. О.С.Соколова. Как увидеть «нано»? Природа, 2010, №9, с.38-43. Full-text PDF
  6. С.С.Шишкин, Л.И.Ковалев, М.А.Ковалева, И.Н.Крахмалева, К.В.Лисицкая, Л.С.Еремина, А.В.Иванов, Е.В.Герасимов, Э.Г.Садыхов, Н.Ю.Уласова, О.С.Соколова, И.Ю.Торопыгин, В.О.Попов. База данных «Протеомика рака простаты». Acta Naturae, 2010, т.2, №4(7), с. 58-68. Full-text PDF

2009 год

  1. I.I.Agapov, O.L.Pustovalova, M.M.Moisenovich, V.G.Bogush, O.S.Sokolova, V.I.Sevastyanov, V.G.Debabov, S.V.Gotye, M.P.Kirpichnikov. Recombinant silk scaffold for tissue engineering. Rare metals, 2009, v. 28, p. 84-87.
  2. V.G.Bogush, O.S.Sokolova, L.I.Davydova, D.V.Klinov, K.V.Sidoruk, N.G. Esipova, T.V.Neretina, I.A.Orchanskyi, V.Yu.Makeev, V.G.Tumanyan, K.V. Shayjtan, V.G.Debabov, M.P.Kirpichnikov. A novel model system for design of biomaterials based on recombinant analogs of spider silk proteins. J Neuroimmune Pharmacol., 2009, v. 4(1), p. 17-27.[abs]Full-text PDF
  3. A.V.Pischalnikova and O.S.Sokolova. The domain and conformational organization in potassium voltage-gated ion channels. Journal of Neuroimmune Pharmacology, 2009, v. 4, Iss.1, p. 71-82.[abs]Full-text PDF
  4. Агапов И.И, Пустовалова О.Л., Мойсенович М.М., Богуш В.Г., Соколова О.С., Севастьянов В.И., Дебабов В.Г., Кирпичников М.П. Трехмерный матрикс из рекомбинантного белка паутины для тканевой инженерии. Доклады академии наук, 2009, т. 426, № 1, c. 115-118. [abs]Full-text PDF
  5. Пустовалова О.Л., Мойсенович М.М., Еремин П.С., Архипова А.Ю., Рамонова А.А., Соколова О.С., Богуш В.Г., Агапов И., Кирпичников М.П. Культивирование клеток на трехмерной матрице из рекомбинантного спидроина 1. Российский иммунологический журнал, 2009, т. 3(12), №2, с. 139-146.

2008 год

  1. Sinitsyna N., Orshansky I., Sokolova O. Actin-binding proteins – how to reval the conformational changes. Journal of Bioinformatics and Computational Biology, 2008, v. 6(4), p. 869–884. [abs]Full-text [PDF]

До 2008 года

  1. Paley E.L., Denisova G., Sokolova O., Posternak N., Wang X., and Brownell A.-L. Tryptamine Induces Tryptophanyl-tRNA Synthetase-Mediated Neurodegeneration With Neurofibrillary Tangles in Human Cell and Mouse Models. Neuro Molecular Medicine, 2007, v. 9, p. 55-82. [abs]Full-text [PDF]
  2. Paley E.L., Smelyanski L., Malinovskii V., Subbarayan P.R., Berdichevsky Y., Posternak N., Gershoni J.M., Sokolova O., Denisova G. Mapping and molecular characterization of novel monoclonal antibodies to conformational epitopes on NH2 and COOH termini of mammalian Tryptophanyl-tRNA Synthetase reveal link of the epitopes to aggregation and Alzheimer's disease. Mol Immunol., 2007, v. 44(4), p. 541-557. [abs]Full-text [PDF]
  3. Rodal A.A., Sokolova O., Robins D., Hippenmeyer S., Riezman H., Grigorieff N., Goode B.L. Conformational changes in the Arp2/3 complex leading to actin nucleation. Nat. Struct. Mol. Biol., 2005, v. 12(1), p. 26-31. [abs]Full-text [PDF]
  4. Sokolova O. Structure of cation channels, revealed by single particle electron microscopy. FEBS Lett., 2004, v. 564(3), p. 251-256. [abs]Full-text [PDF]
  5. Sokolova O., Accardi A., Gutierrez D., Lau A., Rigney M., Grigorieff N. Conformational changes in the C terminus of Shaker K+ channel bound to the rat Kvbeta2-subunit. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2003, v. 100(22), p. 12607-12612. [abs]Full-text [PDF]
  6. Sokolova O., Kolmakova-Partensky L., Grigorieff N. Three-dimensional structure of a voltage-gated potassium channel at 2.5 nm resolution. Structure, 2001, v. 9, p. 215-220. [abs]Full-text [PDF]
  7. Sokolova O.S. Immunochemical methods in aeropalinology. Aerosols, 1996, v. 2(2), p. 21-24.
  8. Only in Russian E.V.Titov, O.S.Sokolova and A.D.Volodarsky. Distribution of lectins throughout Grape stem tissues. Russian journal of plant physiology, 1992, v. 39(1), part. 1, p. 23-28.
  9. А.Д.Володарский, М.В.Сумарока, О.С.Соколова, Н.В.Евсеева, С.Ю.Щеголев. Изучение молекулярных и клеточных основ синтеза пролиферативного антигена инициалей при делении и клеточной дифференциации у растений. Информационный бюллетень РФФИ, 1998, том 6, № 4, с. 417-417.